Edirne İl Jandarma Komutanlığının kuruluş tarihi kesin olarak bilinmemekle birlikte, 1839 yılında zaptiye alayı şeklinde teşkilatlandığı değerlendirilmektedir.
1869 yılında sancak teşkilatına geçilmesinden sonra; Dimetoka, Ortaköy, Uzunköprü ve Havsa’da ilçe teşkilatı kurulmuş ve bu ilçelerde, Kaza Jandarma Komutanlığı, nahiyelerde ise Bucak Jandarma Komutanlığı teşkil edilmiştir.
Edirne İl Jandarma Komutanlığının tarihçesine ilişkin sağlıklı bilgilere 1903 yılından itibaren ulaşılabilmektedir. 1903 yılında Edirne Vilayet Jandarma Alayı; Edirne Merkez, Kırklareli, Tekirdağ, Gelibolu, Dedeağaç, Gümülcine ve Seyyar Süvari Taburları şeklinde teşkilatlanmıştır. Bu teşkilatlanmada, takım ve karakollara yer verilmemiştir.
1922 yılında mülki teşkilata geçilmesiyle birlikte Edirne’de İl Jandarma Alay Komutanlığı teşkil edilmiştir. 10 Temmuz 1961 tarihinde, karakollar ilçe merkezlerinde toplanarak toplu sisteme geçilmiş ve halen bu uygulama sürdürülmektedir.